IBM ускоряет борьбу с раком

Канадские исследователи надеются ускорить борьбу с раком, используя ресурсы глобальной сети, объединяющей сотни тысяч людей, добровольно предоставляющих свободные ресурсы своих компьютеров для решения самых сложных проблем человечества.

Группа исследователей из института Ontario Cancer Institute (OCI) под руководством доктора Игора Юришича (Igor Jurisica), а также научные сотрудники госпиталя Princess Margaret Hospital и объединения University Health Network первыми в Канаде будут использовать поддерживаемую корпорацией IBM (NYSE: IBM) сеть World Community Grid, объединяющую настольные ПК и ноутбуки, чтобы предоставить вычислительные мощности, сопоставимые с показателями производительности одного из пяти самых высокопроизводительных суперкомпьютеров мира.

Группа исследователей будет использовать ресурсы сети World Community Grid для анализа результатов экспериментов над белками, собранных специалистами Научно-исследовательского медицинского института Хауптмана-Вудворда (Hauptman-Woodward Medical Research Institute, Буффало, штат Нью-Йорк). Для проведения этого анализа на обычных вычислительных системах потребовалось бы 162 года. Однако использование сети World Community Grid, как надеется доктор Юришича, позволит выполнить этот анализ за 1-2 года и предоставит исследователям более эффективный способ изучения принципов функционирования белков с целью разработки более действенных методов борьбы с раком.

<Мы знаем, что причиной большинства онкологических заболеваний являются дефектные белки в организме человека, однако нам необходимо лучше понимать специфические функции этих белков и как они взаимодействуют в организме, — отметил Игор Юришича. — Кроме того, мы должны найти белки, которые позволят нам заблаговременно диагностировать рак, до появления его симптомов, чтобы получить больше шансов замедлить развитие заболевания, а возможно, и добиться полного излечения>. В распоряжении исследовательской группы есть более 86 миллионов изображений 9400 уникальных белков, возможно, связанных с раком, которые были собраны в ходе более чем 14,5 миллионов экспериментов, проведенных коллегами из института Хауптмана-Вудворда.

Это самая полная база данных по химии большого количества белков, которая поможет исследователям по всему миру исследовать механизмы развития многих онкологических заболеваний, таких как рак молочной железы, простаты или детская лейкемия.

Только в 2007 году у примерно 150 тысяч канадцев будет диагностирован рак, и более 70 тысяч умрут от этого заболевания.

Сеть World Community Grid, поддерживаемая корпорацией IBM, использует grid-технологии для формирования надежной, гибкой инфраструктуры, предоставляющей исследователям по всему миру готовый набор свободных вычислительных ресурсов, которые могут использоваться для решения проблем, угрожающих человечеству.

Любой желающий может предоставить ресурсы своего компьютера для использования в рамках этого проекта, зарегистрировавшись на Web-сайте www.worldcommunitygrid.org и установив на компьютер небольшую бесплатную и безопасную программу. Компьютер будет запрашивать данные с сервера World Community Grid в периоды простоев — например, когда пользователь уходит пообедать, — и выполнять вычисления в рамках анализа белков, связанных с онкологическими заболеваниями. Специальная экранная заставка будет информировать владельца компьютера о том, что его система используется в этом проекте.

World Community Grid — это крупнейшая общедоступная гуманитарная сеть, объединяющая более 333 тысяч участников и связывающая более 780 тысяч компьютеров. А учитывая тот факт, что в настоящее время в мире насчитывается около миллиарда компьютеров, эта сеть может продолжать расширяться, значительно наращивая вычислительные ресурсы. К настоящему времени сеть World Community Grid обеспечила реализацию восьми проектов, включая программу моделирования процессов сборки белков, а также проект FightAIDS@Home, позволивший провести запланированный на 5 лет цикл исследований вируса иммунодефицита человека всего за 6 месяцев. В настоящее время идет подготовка к реализации еще несколько проектов.